Структура федеральных органов исполнительной власти утверждена Указом Президента № 649 от 20 мая 2004 г. Положение о Федеральной службе в сфере здравоохранения и социального развития утверждено Постановлением Правительства № 323 от 30 июня 2004 г. Приказом Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации от 22 ноября 2004 г. № 205 было утверждено «Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития по субъекту Российской Федерации». В 2012 году приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 13 декабря 2012 г. № 1040н «Об утверждении Положения о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения» утверждено новое Положение.
Приказом Росздравнадзора от 06.06.2013 № 2282-Пр/13 утверждено «Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Псковской области». Новое наименование Управления - Территориальный орган Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Псковской области (Территориальный орган Росздравнадзора по Псковской области).

На сегодня штатная численность Территориального органа Росздравнадзора по Псковской области составляет двенадцать человек. Укомплектованность штата Территориального органа - восемь человек.

Основные полномочия Территориального органа Росздравнадзора по Псковской области - контроль в сфере здравоохранения, надзор за фармацевтической деятельностью, а также лицензирование медицинской, фармацевтической деятельности и деятельности, по обороту наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров, культивированию наркосодержащих растений и пр.